Analyse de réseau(x)

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Ressources méthodologiques

◦ École d'été Initiation à l'analyse de réseaux 2017

Vous pouvez consultez ci-dessous les bibliographies conseillées par les intervenant.e.s et les supports de cours présentés lors de cette première école d'été organisée par le GDR Analyse de réseaux en SHS et le groupe Res-Hist (Réseaux et histoire) à Nice du 3 au 8 juillet 2017.

◦ École thématique Réseaux et complexité (Cargèse, 2018)

Le carnet du groupe de recherche analyse de réseau en sciences humaines et sociales (arshs) met a disposition le programme détaillé et les supports des conférences et ateliers qui ont eu lieu du 24 au 28 septembre 2018 dans le cadre de l'école thématique Réseaux et complexité organisée par le CNRS.

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◦ Cytoscape

Cytoscape est un logiciel libre et gratuit d'analyse et de visualisation développé par des biologistes pour de gros jeux de données. Il permet de construire un réseau à partir d'une liste de liens et d'une liste de sommets. La version dite de base peut être augmentée par des "apps" dédiées à certains champs disciplinaires (bioinformatique, analyse des réseaux sociaux, ...). La documentation et des tutoriels sont disponibles en ligne (en anglais). Le logiciel est téléchargeable ici

Tutoriel en français réalisé par des étudiants de l’ENSAI en 2017. Tutoriel en français rédigé par Guillaume Brysbaert et Sébastien Plutniak (2018, atelier R et Cytoscape de l'école thématique réseaux et complexité)

◦ Gephi

Gephi est un logiciel libre et gratuit de visualisation des données (il se définit comme le "Photoshop pour graphes"). Il est téléchargeable ici. Les tutoriels de prise en main et la documentation complète sont disponible ici, en anglais. Un tutoriel en français est également disponible, il a été réalisé par deux étudiants de l'ENSAI en 2017

◦ Bibliothèques de fonctions R

Toute la documentation et les liens de téléchargement pour R se trouvent sur le site web du CRAN (Comprehensive R Archive Network). Vous pouvez aussi télécharger Rstudio, environnement de développement intégré à l'interface graphique dédiée à l'utilisation de R. C'est également libre, gratuit et multi-plateforme

◦ R - package igraph

igraph : dédié au traitement et à l'analyse de graphe, développé principalement par des physicien.ne.s. Tutoriel en française rédigé par Sébastien Plutniak (2018, atelier R et Cytoscape de l'école thématique réseaux et complexité)

◦ R - package statnet

statnet : dédié au traitement et à l'analyse de graphe, développé principalement par des sociologues et des statisticien.ne.s

 

◦ R - package tnet

tnet : dépend de la bibliothèque igraph (celle-ci est installée à l'installation de tnet)

 

 

◦ R - package bipartite

bipartite : dédié aux réseaux bipartis, développé par des écologues. Tutoriel en français rédigé par Camille Brisson et Chloé Migayrou, étudiantes de l'ENSAI en 2017

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